Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms