Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATOH8Q96SQ7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms