Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMD3Q96D46 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms