Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms