Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD6Q92537 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms