Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113Q902F9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms