Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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