Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHDC9Q8NEP7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms