Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CLDN19Q8N6F1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN19Q8N6F1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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