Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCDC80Q76M96 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC80Q76M96 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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