Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms