Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL38Q2WGJ6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms