Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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