Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKIV2LQ15477 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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