Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms