Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms