Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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