Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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