Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TROQ12816 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TROQ12816 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TROQ12816 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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