Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNMA1Q12791 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms