Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms