Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BACE1P56817 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BACE1P56817 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms