Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AFF3P51826 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AFF3P51826 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms