Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK1EP49674 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1EP49674 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms