Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGP37231 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms