Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MSX1P28360 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MSX1P28360 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MSX1P28360 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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