Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD10P28358 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD10P28358 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms