Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC9A1P19634 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC9A1P19634 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms