Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB3P14651 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms