Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIMD1P0DJR0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIMD1P0DJR0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms