Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IL3P08700 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL3P08700 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL3P08700 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL3P08700 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms