Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC2O95409 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC2O95409 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC2O95409 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZIC2O95409 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC2O95409 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC2O95409 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms