Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITM2AO43736 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITM2AO43736 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms