Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F3O00716 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms