Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARID3CA6NKF2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms