Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM247A6NEH6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM247A6NEH6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM247A6NEH6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms