Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC144AA2RUR9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms