Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F8A0AVK6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms