Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms