Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms