Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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