Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHMP3Q9Y3E7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms