Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms