Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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