Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRBP1Q9P2E9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms