Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms