Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms