Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms