Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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