Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms